Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTX3P26022 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms