Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms