Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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