Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATF1P18846 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATF1P18846 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATF1P18846 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATF1P18846 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATF1P18846 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATF1P18846 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms