Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD46P15529 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD46P15529 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD46P15529 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD46P15529 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD46P15529 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD46P15529 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms