Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms