Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA4P13612 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms