Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB1P11230 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms