Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD28P10747 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD28P10747 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD28P10747 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD28P10747 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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