Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms