Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFLP07196 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms