Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC3P02656 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOC3P02656 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms