Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP19O94966 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP19O94966 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms