Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms