Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms