Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms