Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms