Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNPHO15079 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNPHO15079 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNPHO15079 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNPHO15079 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNPHO15079 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SNPHO15079 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNPHO15079 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNPHO15079 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNPHO15079 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms