Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPEF1O14829 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms