Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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