Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERINC4A6NH21 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms