Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFAP73A6NFT4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms