Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms