Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A087WWV3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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