Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN6Q9Y6Q1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN6Q9Y6Q1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN6Q9Y6Q1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN6Q9Y6Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
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