Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00312Q9Y6C7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00312Q9Y6C7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00312Q9Y6C7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00312Q9Y6C7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LINC00312Q9Y6C7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms