Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD54BQ9Y620 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD54BQ9Y620 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD54BQ9Y620 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms