Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAI2Q9Y5P3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAI2Q9Y5P3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAI2Q9Y5P3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAI2Q9Y5P3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms