Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF12Q9Y4X4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF12Q9Y4X4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF12Q9Y4X4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms