Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF6Q9Y4K3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF6Q9Y4K3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF6Q9Y4K3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms