Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
REXO2Q9Y3B8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
REXO2Q9Y3B8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
REXO2Q9Y3B8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms