Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSUH2Q9Y2M2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSUH2Q9Y2M2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSUH2Q9Y2M2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms