Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMD4BQ9Y2L6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMD4BQ9Y2L6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMD4BQ9Y2L6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD4BQ9Y2L6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD4BQ9Y2L6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD4BQ9Y2L6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD4BQ9Y2L6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms