Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC4Q9Y296 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC4Q9Y296 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms