Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2BQ9Y287 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITM2BQ9Y287 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms