Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN8AQ9UQD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN8AQ9UQD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN8AQ9UQD0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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