Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAPRE3Q9UPY8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAPRE3Q9UPY8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 738.1 ms