Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PHF8Q9UPP1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PHF8Q9UPP1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PHF8Q9UPP1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PHF8Q9UPP1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PHF8Q9UPP1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PHF8Q9UPP1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
PHF8Q9UPP1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF8Q9UPP1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF8Q9UPP1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PHF8Q9UPP1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF8Q9UPP1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms