Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCAF8Q9UPN6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAF8Q9UPN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCAF8Q9UPN6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCAF8Q9UPN6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms