Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
INO80Q9ULG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
INO80Q9ULG1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
INO80Q9ULG1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
INO80Q9ULG1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
INO80Q9ULG1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms