Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AMFRQ9UKV5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AMFRQ9UKV5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMFRQ9UKV5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMFRQ9UKV5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms