Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ADAM28Q9UKQ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ADAM28Q9UKQ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ADAM28Q9UKQ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ADAM28Q9UKQ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms