Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL4Q9UJQ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL4Q9UJQ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL4Q9UJQ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL4Q9UJQ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms