Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD1Q9UIS9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD1Q9UIS9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD1Q9UIS9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms