Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HERC5Q9UII4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HERC5Q9UII4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HERC5Q9UII4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HERC5Q9UII4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms