Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTNNA3Q9UI47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTNNA3Q9UI47 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTNNA3Q9UI47 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTNNA3Q9UI47 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms