Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRM2Q9UI43 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRM2Q9UI43 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRM2Q9UI43 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MRM2Q9UI43 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRM2Q9UI43 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRM2Q9UI43 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRM2Q9UI43 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms