Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED13Q9UHV7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED13Q9UHV7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED13Q9UHV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms