Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMTOR3Q9UHA4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms