Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF1Q9UH73 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
EBF1Q9UH73 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF1Q9UH73 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms